MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 58001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015942	GGT	2	6	177213	177218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198398
3502	NC_015942	GGT	2	6	177264	177269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198398
3503	NC_015942	TCG	2	6	177289	177294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198398
3504	NC_015942	CGG	2	6	177443	177448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198398
3505	NC_015942	GTT	2	6	177462	177467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198398
3506	NC_015942	CAG	2	6	177552	177557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198398
3507	NC_015942	CGT	2	6	177590	177595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198398
3508	NC_015942	TTC	2	6	177604	177609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198398
3509	NC_015942	CTT	2	6	177684	177689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198398
3510	NC_015942	TCC	2	6	177709	177714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198398
3511	NC_015942	AGC	2	6	177715	177720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198398
3512	NC_015942	GGC	2	6	177744	177749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198398
3513	NC_015942	CGG	2	6	177758	177763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198398
3514	NC_015942	TCG	2	6	177829	177834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198398
3515	NC_015942	GCC	2	6	177844	177849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198398
3516	NC_015942	GGTCG	2	10	178146	178155	0 %	20 %	60 %	20 %	344198399
3517	NC_015942	CG	3	6	178178	178183	0 %	0 %	50 %	50 %	344198399
3518	NC_015942	TGC	2	6	178215	178220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198399
3519	NC_015942	CGA	2	6	178227	178232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198399
3520	NC_015942	CTG	2	6	178252	178257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198399
3521	NC_015942	C	6	6	178285	178290	0 %	0 %	0 %	100 %	344198399
3522	NC_015942	TCC	2	6	178331	178336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198399
3523	NC_015942	CGC	2	6	178383	178388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198399
3524	NC_015942	CAGA	2	8	178417	178424	50 %	0 %	25 %	25 %	344198399
3525	NC_015942	CGGT	2	8	178568	178575	0 %	25 %	50 %	25 %	344198399
3526	NC_015942	TCGTGT	2	12	178613	178624	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	344198399
3527	NC_015942	TCG	2	6	178745	178750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198399
3528	NC_015942	CGC	2	6	178770	178775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198399
3529	NC_015942	TCG	2	6	178778	178783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198399
3530	NC_015942	TGA	2	6	178806	178811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198399
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3532	NC_015942	GTTT	2	8	178969	178976	0 %	75 %	25 %	0 %	344198400
3533	NC_015942	AGT	2	6	179102	179107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198400
3534	NC_015942	ACAT	2	8	179143	179150	50 %	25 %	0 %	25 %	344198400
3535	NC_015942	CGT	2	6	179165	179170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198400
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3537	NC_015942	GCA	2	6	179300	179305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198400
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3539	NC_015942	GCGG	2	8	179361	179368	0 %	0 %	75 %	25 %	344198400
3540	NC_015942	GCG	2	6	179603	179608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198400
3541	NC_015942	TTCT	2	8	179625	179632	0 %	75 %	0 %	25 %	344198400
3542	NC_015942	GCAA	2	8	179706	179713	50 %	0 %	25 %	25 %	344198400
3543	NC_015942	GGC	2	6	179748	179753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198400
3544	NC_015942	CTGA	2	8	179791	179798	25 %	25 %	25 %	25 %	344198400
3545	NC_015942	TTC	2	6	179952	179957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198400
3546	NC_015942	TCT	2	6	179989	179994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198401
3547	NC_015942	GCC	2	6	180008	180013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198401
3548	NC_015942	CTG	2	6	180043	180048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198401
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3550	NC_015942	AC	3	6	180169	180174	50 %	0 %	0 %	50 %	344198401
3551	NC_015942	ACC	2	6	180333	180338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198401
3552	NC_015942	GCG	2	6	180364	180369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198401
3553	NC_015942	CG	3	6	180413	180418	0 %	0 %	50 %	50 %	344198401
3554	NC_015942	GCC	2	6	180435	180440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198401
3555	NC_015942	TGG	2	6	180496	180501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198401
3556	NC_015942	CGT	2	6	180514	180519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198401
3557	NC_015942	TCT	2	6	180550	180555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198401
3558	NC_015942	CCG	2	6	180636	180641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198401
3559	NC_015942	CATC	2	8	180658	180665	25 %	25 %	0 %	50 %	344198401
3560	NC_015942	CTC	2	6	180686	180691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198401
3561	NC_015942	GAT	2	6	180692	180697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198401
3562	NC_015942	GAT	2	6	180758	180763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198401
3563	NC_015942	CGG	2	6	180805	180810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198401
3564	NC_015942	GGT	2	6	180877	180882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198401
3565	NC_015942	CGT	2	6	180904	180909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198401
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3570	NC_015942	ACGG	2	8	181022	181029	25 %	0 %	50 %	25 %	344198401
3571	NC_015942	GA	3	6	181030	181035	50 %	0 %	50 %	0 %	344198401
3572	NC_015942	CTT	3	9	181043	181051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198401
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3581	NC_015942	CAC	3	9	181549	181557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198402
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3583	NC_015942	TGA	2	6	181602	181607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198402
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3585	NC_015942	GCC	2	6	181681	181686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198402
3586	NC_015942	GGA	2	6	181706	181711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198402
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3588	NC_015942	CCA	2	6	181752	181757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198402
3589	NC_015942	GC	3	6	181828	181833	0 %	0 %	50 %	50 %	344198402
3590	NC_015942	TGC	2	6	181845	181850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198402
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3593	NC_015942	CCA	2	6	181899	181904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198402
3594	NC_015942	GCC	2	6	181910	181915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198402
3595	NC_015942	GCC	2	6	181927	181932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198402
3596	NC_015942	CAG	2	6	181990	181995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198402
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3598	NC_015942	CG	3	6	182103	182108	0 %	0 %	50 %	50 %	344198402
3599	NC_015942	CGG	2	6	182156	182161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198402
3600	NC_015942	CCT	2	6	182244	182249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198402
3601	NC_015942	CGGT	2	8	182336	182343	0 %	25 %	50 %	25 %	344198402
3602	NC_015942	CG	3	6	182397	182402	0 %	0 %	50 %	50 %	344198402
3603	NC_015942	CGG	3	9	182408	182416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198402
3604	NC_015942	CTC	2	6	182422	182427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198402
3605	NC_015942	GTC	2	6	182428	182433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198402
3606	NC_015942	TTCC	2	8	182440	182447	0 %	50 %	0 %	50 %	344198402
3607	NC_015942	GGC	2	6	182560	182565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198402
3608	NC_015942	GTT	2	6	182575	182580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198402
3609	NC_015942	TTG	2	6	182587	182592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198402
3610	NC_015942	GGTC	2	8	182601	182608	0 %	25 %	50 %	25 %	344198402
3611	NC_015942	TGC	2	6	182641	182646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198403
3612	NC_015942	GCG	2	6	182680	182685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198403
3613	NC_015942	GCG	2	6	182722	182727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198403
3614	NC_015942	ATC	2	6	182800	182805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198403
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3617	NC_015942	CAG	2	6	182991	182996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198403
3618	NC_015942	CGCA	2	8	183003	183010	25 %	0 %	25 %	50 %	344198403
3619	NC_015942	ATG	2	6	183015	183020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198403
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3742	NC_015942	GCCGAT	2	12	189496	189507	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344198412
3743	NC_015942	CGC	3	9	189637	189645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198412
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3773	NC_015942	GC	3	6	191388	191393	0 %	0 %	50 %	50 %	344198414
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3843	NC_015942	GAT	2	6	194455	194460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198416
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3984	NC_015942	TGC	2	6	201336	201341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198423
3985	NC_015942	GCC	2	6	201420	201425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198423
3986	NC_015942	TCG	2	6	201448	201453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198423
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